Духовная академия — высшее церковное учебное заведение, готовящее богословов, преподавателей теологии. Первой из них была киевская, основанная в XVII в. В настоящее время Русская православная церковь имеет Духовные академии — в Сергиевом Посаде, Санкт-Петербурге, Киеве, Московская духовная академия, Санкт-Петербургская духовная академия, Киевская духовная академия, Минская духовная академия, Кишинёвская духовная академия, Сретенская духовная академия.

Обучение — четырёхгодичное. Академия РПЦ включает в себя 6 структурных подразделений: бакалавриат, магистратуру, аспирантуру, докторантуру, регентскую и иконописную школы. Период обучения на бакалавриате – 4 года. Успешное окончание бакалавриата даёт право на поступление в магистратуру Академии, период обучения в которой составляет 2 года. Срок обучения в очной аспирантуре 3 года, в заочной - 4 года. Основными целями подготовки в Аспирантуре являются: проведение научно-богословских исследований; сдача кандидатских экзаменов; написание диссертации на соискание ученой степени кандидата богословия.

Также с 2017 года в России действует Болгарская исламская академия (г. Болгар, Спасский район, Татарстан), которая представляет собой федеральный проект, поддержанный Президентом Российской Федерации В.В. Путиным. Её создание инициировано Центральным духовным управлением мусульман России (г. Уфа), Духовным управлением мусульман Российской Федерации (г. Москва) и Духовным управлением мусульман Республики Татарстан (г. Казань). В Академии реализуются трёхгодичные профессиональные образовательные программы высшего религиозного образования магистратуры и докторантуры по направлению «Подготовка служителей и религиозного персонала религиозных организаций» (область «Исламские науки», профиль «Исламское право», «Исламское вероучение», «Корановедение», «Хадисоведение»), а также программа магистратуры по направлению 48 04 01 «Теология» (профиль «Государственно-конфессиональные отношения в контексте исламской теологии»).

См. Академия